Bakteriel vaginose er betegnelsen for en forstyrrelse i bakteriefloraen i vagina (skeden), hvor de normale lactobaciller (mælkesyrebakterier) er forsvundet, og i stedet er der indtrådt en opformering af en lang række andre anærobe (ikke iltkrævende) bakterier.
Der er ikke tale om en sexsygdom, da mænd ikke bliver smittet, men alligevel skal den omtales, da sygdommen formentlig er den hyppigste årsag til, at kvinder får udflåd fra vagina (skeden).
Man kender ikke årsagen til, at nogle kvinder får bakteriel vaginose, men hyppig samleje kan muligvis disponere.